Co je dobré vědět
- Soubor FNA je soubor pro zarovnání DNA a proteinové sekvence formátu FASTA.
- Otevřete jeden pomocí Geneious.
- Převést na FASTA a podobné formáty pomocí stejného programu.
Tento článek vysvětluje, co je soubor FNA, jak jej otevřít a jak jej uložit do jiného formátu, jako je FASTA, GB, VCF, obrázky atd.
Co je soubor FNA?
Soubor s příponou FNA je soubor FASTA Format DNA and Protein Sequence Alignment, který uchovává informace o DNA, které mohou být použity softwarem molekulární biologie.
Soubory FNA lze konkrétně použít k uložení pouze informací o nukleové kyselině, zatímco jiné formáty FASTA obsahují další informace související s DNA, jako jsou soubory s FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET nebo AA přípony souborů.
Tyto textové formáty FASTA původně vznikly ze softwarového balíku se stejným názvem, ale nyní se používají jako standard v aplikacích pro zarovnání DNA a proteinových sekvencí.
FNA také odkazuje na některé technologické termíny, které nemají nic společného s tímto formátem souboru, jako je konečné přijetí sítě, možnost rozšíření názvu souboru/atributu, architektura sítě Fujitsu a rychlá reklama sousedů.
Jak otevřít soubor FNA
Otevřete jeden ve Windows, macOS a Linux pomocí Geneious (je to zdarma na 14 dní). Chcete-li to provést, přejděte do nabídky File > Import a zvolte import souboru pomocí From Filepoložka nabídky.
Mohli byste jej otevřít také pomocí BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Pokud tyto nápady nefungují, zkuste Notepad++ nebo jiný textový editor. Soubor může být skutečně textový a snadno čitelný, nebo můžete zjistit, že nemá nic společného s formátem FASTA, v takovém případě může otevření souboru jako textového dokumentu odhalit text, který identifikuje, co bylo použito k vytvoření souboru. nebo v jakém formátu je soubor.
Jak převést soubor FNA
Nemůžeme to ověřit, protože jsme to nezkusili, ale měli byste být schopni použít Geneious k převodu souboru do mnoha dalších formátů, jako je FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV a VCF. To lze provést prostřednictvím nabídky File > Export programu.
Tentýž program by měl být schopen uložit soubor do formátu PNG, JPG, EPS nebo PDF prostřednictvím File > Uložit jako soubor obrázku.
I když normálně nemůžete jednoduše přejmenovat příponu souboru na něco jiného a očekávat, že bude fungovat stejným způsobem, můžete přejmenovat soubor. FNA na soubor. FA, pokud váš konkrétní software pro sekvenování DNA rozpozná pouze formát FA.
Místo přejmenování přípon souborů budete chtít použít bezplatný konvertor souborů k převodu jiných typů souborů. V případě souborů FNA a FA se jen tak stane, že některé programy otevřou pouze soubory, které mají příponu FA, v takovém případě by přejmenování mělo fungovat dobře.
Stále to nejde otevřít?
Pokud po použití výše uvedených programů stále nemůžete soubor otevřít, možná zjistíte, že přípona souboru ve skutečnosti nečte. FNA, ale místo toho něco, co vypadá podobně.
Například soubory FNG (Font Navigator Group) vypadají strašně, jako by říkaly „. FNA“, ale když se podíváte pozorně, pouze první dvě písmena jsou stejná. Protože se přípony souborů liší, znamená to, že mají jiný formát souboru a pravděpodobně nebudou fungovat se stejnými programy.
Totéž lze říci o mnoha dalších příponách souborů, jako je FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) a FND (Windows Saved Search).
Cílem je pouze zajistit, aby přípona souboru byla. FNA. Pokud ano, zkuste jej znovu otevřít nebo převést pomocí programů shora. Pokud máte jiný typ souboru, prozkoumejte jeho příponu a zjistěte, které aplikace jsou potřeba k jeho otevření nebo převodu.
FAQ
Jak otevřete soubor FNA v Pythonu?
Nejprve převeďte soubor FNA do formátu FASTA pomocí aplikace třetí strany, jako je Geneious. Poté si můžete stáhnout Biopython, sadu volně dostupných nástrojů pro biologické výpočty pro práci v bioinformatice. Nakonec si přečtěte návod a kuchařku Biopython, kde najdete pokyny pro práci se soubory FASTA.
Jak najdu svá čísla výrobce FNA v nezpracovaném souboru Ancestry?
Většinu dat DNA si můžete stáhnout z Ancestry.com ve formátu.txt. Pouze zákazníci, jejichž DNA byla analyzována pomocí sekvenování nové generace (NGS), však mají možnost stáhnout soubor VCF. Chcete-li stáhnout soubor VCF, musíte být vlastníkem DNA, musíte mít DNA testovanou pomocí technologie NGS a mít v zařízení k dispozici alespoň 350 MB místa.
